从可免费访问的在线数据库（如SCUBIDOO和Selleckchem）收集化合物的SMILES格式文件，进行标准化的处理，获得其物理化学信息，并运用各种生物化学类软件进行文件转化，主要以sdf,mol2,pdbqt等文件形式进行储存，目前收集了20多个数据库，其中包括了多个上市类，共3亿多个小分子。